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近年來，由於兩岸事務日增，為因應情勢需要，乃在總統府設立國家統一委員會，於行政院設大陸委員會。唯以此類機關之設立與運作而言，卻再度開啓所謂「府院」權限之疑慮與爭議。加以過去國家安全會議的設置，即有侵奪行政院職掌的批評，此類設置於總統府的委員會，於動態運用過程，多不免於有此議論。如從内閣制國家之實際運用而論，元首所主持的此類委員會應為「整合性」、「諮詢性」、「溝通協調性」等性質，是幕僚機關。我國總統府内這類委員會，大致具有此一「應然」的性質。其中，稽勳委員會賦有執行業務，為實作機關，非幕僚機關，可說是例外。是以總統府下的行政委員會，其功能與實際操作，可以觀察政府機關間的互動模式。申言之，此類委員會的運行，和政體趨向有相當程度的關聯。在總統之選舉方式、總統與行政院及立法院關係等，尚未明朗的發展定向之前，或許可以看出一些端倪。

行政委員會、總統府、行政院、組織